Защитить балалайку от механических повреждений, сколов, дождя, снега, пыли и грязи поможет чехол или кейс, предмет первой необходимости для любого инструмента. Поскольку балалайки сильно различаются размерами (для примера, мензура балалайки прима составляет всего 440 мм, а балалайки контрабас целых 1180 мм), то и выбирать чехол следует исходя из разновидности инструмента.